全話第41話 華麗なフラム24分 7日間 110 pt 〜連邦軍によるルナベース奪還作戦での戦いはさらに激化する。その戦いの中で、キオは、コクピットを破壊しないようにヴェイガンのMSを撃破し、パイロットを救う戦い方を続けていた。キオは戦場に現れたフラムに、ともにXラウンダーの力を使い、争いをやめさせようという提案をするが…。
全話第42話 ジラード・スプリガン24分 7日間 110 pt 〜連邦軍とヴェイガンの戦いは、両軍とも譲らない激しいものとなっていた。だがそこへ元連邦のパイロット、ジラード・スプリガンが参戦する。キオは、ジラードが連邦とヴェイガン、両陣営の実情を知る人間だと知り、戦いを終わらせるための対話を試みるが…。
全話第43話 壮絶 トリプルガンダム24分 7日間 110 pt 〜月面上の戦いはさらに激しさを増す。連邦軍ではプラズマダイバーミサイル発射の準備がなされていた。セリックは、強力な殺戮兵器であるミサイルの発射を止めされるため、ヴェイガン兵を降伏させようと試みる。
全話第44話 別れ行く道24分 7日間 110 pt 〜イゼルカントは、ゼハートにプロジェクト・エデンの真の目的を告げ、自らの代わりにヴェイガンを率いるよう命じる。ゼハートは全てを理解した上で、イゼルカントの言葉に従うことを決意する。一方、連邦側では、フリット、アセム、キオ、それぞれの戦争に対する考え方の違いから三人による口論が繰り広げられていた。フリットのヴェイガン殲滅という強い意志に、キオは、ヴェイガンの全てが悪いわけじゃないと立ち向かう。何のために戦うのか、そして、その終わりはどこにあるのか。アスノ家三代の親子は、それぞれの歩む道を見出し、進んでいく。
全話第45話 破壊者シド24分 7日間 110 pt 〜人類の過去の戦いにおけるテクノロジーが封じられた悪魔の秘宝『EXA-DB』。それを守護していたのは、巨大な怪物モビルスーツだった。ヴェイガンの最高司令官となったゼハートは、自らにその資格があるかを問うため、イゼルカントに託されたガンダムレギルス一機でシドとの戦闘に挑む。だが、シドはレギルスの攻撃を次々とはねつけてしまう。追い詰められるゼハート。絶体絶命と思われたその時、レギルスの前に、黒いMSが現れる。
全話第46話 宇宙要塞ラ・グラミス24分 7日間 110 pt 〜ヴェイガンは、セカンドムーンとラ・グラミスの連携による、大規模な侵攻作戦を実行しようとしていた。連邦もまた、それを迎え討つべく、宇宙要塞ラ・グラミス攻略作戦を発令する。両軍では最終決戦に向かう戦士たちが、それぞれ思いを巡らせる。果たして、この戦いの先にはどのような結末が待っているのか。地球の命運をかけた、両軍の激突は目前であった。
全話第47話 青い星 散りゆく命24分 7日間 110 pt 〜ラ・グラミスでの激しい戦闘が続く中、キオが戦場で出会ったのは、ヴェイガンでありながら、かつて心を通じ合わせたディーンだった。キオにとって、Xラウンダーの力を使い襲ってくるディーンは、誰よりも手強い相手だった…。
全話第48話 絶望の煌き24分 7日間 110 pt 〜ゼハートは、プロジェクト・エデン達成のため、仲間の犠牲を覚悟の上で、ディグマゼノン砲を再発射する。ディーヴァは撃沈されるが、フリットたちは攻撃を予測し、ディーヴァクルーとガンダムを救う。この攻撃の失敗によって、ゼハートは追いこまれていく。その時、アセムは…。
全話第49話 長き旅の終わり24分 7日間 110 pt 〜宇宙要塞ラ・グラミスでの戦いは最終局面となる。連邦とヴェイガンは、共に大きな被害を受けるものの退かず、戦況はさらに激しさを増していく。長い戦いの果てに、フリット、アセム、キオ、そして、イゼルカントは、どのような結末を迎えるのか?